Jádro
Jedním z hlavních rozdílů mezi prokaryotickou a eukaryotickou buňkou je jádro. Jak již bylo řečeno, prokaryotické buňky postrádají organizované jádro, zatímco eukaryotické buňky obsahují jádra (a organely ) vázaná na membránu, v nichž je uložena buněčná DNA a řízena syntéza ribozomů a proteinů.
Jádro uchovává chromatin (DNA plus proteiny) v gelovité látce zvané nukleoplazma. Pro pochopení chromatinu je užitečné se nejprve zabývat chromozomy. Chromatin popisuje materiál, který tvoří chromozomy, což jsou struktury v jádře, které jsou tvořeny DNA, dědičným materiálem. Možná si vzpomenete, že u prokaryot je DNA uspořádána do jednoho kruhového chromozomu. U eukaryot jsou chromozomy lineární struktury. Každý eukaryotický druh má v jádrech svých tělních buněk určitý počet chromozomů. Například u člověka je počet chromozomů 46, zatímco u ovocných mušek je to osm. Chromozomy jsou viditelné a rozlišitelné jeden od druhého pouze tehdy, když se buňka připravuje na dělení. Aby bylo možné uspořádat velké množství DNA v jádře, jsou k chromozomům připojeny bílkoviny zvané histony; DNA se kolem těchto histonů ovíjí a vytváří strukturu připomínající korálky na šňůrce. Tyto komplexy bílkovin a chromozomů se nazývají chromatin.
V nukleoplazmě najdeme také jádro. Nukleolus je kondenzovaná oblast chromatinu, kde dochází k syntéze ribozomů. Ribosomy, velké komplexy bílkovin a ribonukleové kyseliny (RNA), jsou buněčné organely odpovědné za syntézu bílkovin. Své „příkazy“ k syntéze bílkovin dostávají z jádra, kde se DNA přepisuje do messengerové RNA (mRNA). Tato mRNA putuje k ribozomům, které překládají kód daný pořadím dusíkatých bází v mRNA do konkrétního pořadí aminokyselin v bílkovině.
Nakonec se hranice jádra nazývá jaderný obal. Skládá se ze dvou fosfolipidových dvojvrstev: vnější membrány a vnitřní membrány. Jaderná membrána je spojitá s endoplazmatickým retikulem, zatímco jaderné póry umožňují vstup látek do jádra a jejich výstup z něj.
.