Kohdun erittymisvaiheen aikana munasarjat tuottavat progesteronihormonia. Progesteronia (samoin kuin estrogeenia) erittää keltarauhanen (corpus luteum, joka tarkoittaa keltarauhasta), joka kehittyy Graafian follikkelista. Keltarauhasen erittämä progesteroni stimuloi kohdun limakalvon solujen kertymistä edelleen. Progesteroni stimuloi myös kohdun rauhasia erittämään aineita, jotka ylläpitävät kohdun limakalvoa ja estävät sitä hajoamasta. Tästä syystä kuukautiskierron tätä vaihetta kutsutaan eritysvaiheeksi.
Estrogeenin ja progesteronin läsnäolo veressä estää aivolisäkkeen FSH:n ja LH:n tuotantoa, ja FSH- ja LH-tasot alkavat laskea.
Jos munanjohtimeen ovuloitunut munasolu hedelmöittyy siittiöiden avulla, kehittyvä sikiö implantoituu kohdun paksuuntuneeseen kohdun limakalvoon noin seitsemän päivää ovulaation jälkeen. Tämä stimuloi kohdun limakalvoa erittämään ihmisen koriongonadotrooppista hormonia (HCG). HCG ylläpitää keltarauhasen munasarjassa niin, että se jatkaa progesteronin eritystä. HCG:tä erittyy koko raskauden ajan ja se pitää veren progesteronipitoisuuden korkeana, jotta kohdun limakalvo jatkaa paksuuntumistaan ja muodostaa lopulta istukan. Ilman korkeaa progesteronitasoa kohdun limakalvo alkaa hajota. Raskaudessa kohdun limakalvon hajoaminen johtaisi keskenmenoon.
Kuukautiskierto. Kuvitus: Hans & Cassidy. Courtesy of Gale Group.
Jos hedelmöittymistä ei tapahdu, keltarauhanen kutistuu ja veren progesteronipitoisuus laskee, noin 22. päivänä 28 päivän syklissä. Ilman progesteronia kohdun limakalvo rappeutuu, ja se poistuu kohdunkaulan kautta ja emättimen kautta ulos.