W glonach występują dwa podstawowe typy komórek: prokariotyczne i eukariotyczne. Komórki prokariotyczne brak organelli związanych z błoną (plastydów, mitochondriów, jąder, ciałek Golgiego, i flagella) i występują w sinice. Pozostała część glonów jest eukariotyczna i posiada organelle.
Struktura komórkowa sinic
Komórka bakteryjna: Komórka prokariotyczna
Komórka eukariotyczna jest często otoczona ścianą komórkową złożoną z polisacharydów, które są częściowo wytwarzane i wydzielane przez ciało Golgiego. Błona plazmatyczna (plazmalemma) otacza pozostałą część komórki; błona ta jest żywą strukturą odpowiedzialną za kontrolę napływu i odpływu substancji w protoplazmie. Narządy lokomotoryczne, flagelle, poprzez swoje bicie napędzają komórkę w ośrodku. Flagi są zamknięte w błonie plazmatycznej i mają określoną liczbę i orientację mikro kanalików. Jądro, w którym znajduje się materiał genetyczny komórki, otoczone jest podwójną błoną, w której znajdują się pory. Zawartość jądra stanowi nukleol, chromosomy oraz materiał zapasowy, czyli kariolimfa. W chloroplastach znajdują się błoniaste woreczki zwane tylakoidami, które przeprowadzają reakcje świetlne fotosyntezy. Tylakoidy są osadzone w zrębie, gdzie zachodzą ciemne reakcje wiązania węgla. W zrębie znajdują się małe rybosomy 70S, DNA, a w niektórych przypadkach także produkt magazynowania. Chloroplasty są otoczone przez dwie błony otoczki chloroplastowej. Czasami chloroplasty mają gęsty białkowy obszar, pirenoid, który jest związany z tworzeniem produktów magazynowania.
Dwumembranowe mitochondria mają rybosomy 70S i DNA oraz zawierają aparat oddechowy. Ciało Golgiego składa się z szeregu błoniastych woreczków, zwanych cysternami, ułożonych jeden na drugim. Ciało Golgiego funkcjonuje w procesie pro dukcji i sekrecji polisacharydów. Cytoplazma zawiera również duże rybosomy 80S i ciała lipidowe.