Ez a dal az album zárásaként szolgál, és egy hangos, ismétlődő dallammal épül fel, majd egy nagyon csendes outróval zárul. Amikor a fő hangszerelés 1:30-nál véget ér, megjelenik az első szám, a “Speak to Me” szívdobbanásának hangja, amely 9/8-ban ismét megjelenik, és fokozatosan csendbe megy át.
Harmonikusan a dal egy ismétlődő 4 ütemű akkordmenetből áll: D, D/C, B♭maj7 és A7sus4, amely A7-re oldódik fel. A basszusvonal egy ereszkedő tetrachord.
David Gilmour két ritmusgitár-sávot vett fel, ahol arpeggiókat játszik, egyet nyitott pozícióban, egyet pedig sokkal magasabban, a tizedik bund körül. A mélyebb fekvésű gitárszólam a B♭maj7 alatt a nyitott G és E húrokat foglalja magába, ami egy hozzáadott hatodot és egy disszonáns augmentált negyedet eredményez. A női háttérénekesek kvartettje variálja a szólamokat, hangerőben emelkedik, és visszhangozza Roger Waters néhány szövegét, ahogy a darab egyre intenzívebbé válik. Az akkordmenet utolsó ismétlésénél a B♭maj7 közvetlenül a D-dúr csúcsponthoz vezet, ami egy “felderítő” hatást eredményez (az úgynevezett Picardy terc), mivel a B♭maj7 akkordban a d-moll fent említett implikációja a dúrba tolódik át.
Waters a “Brain Damage” / “Eclipse” zárószekvenciájának szövegét útközben írta, mivel úgy érezte, hogy az egész darab “befejezetlen”. A dalban, sőt, a The Dark Side of the Moon című albumon énekelt zárószavak így irányítják a hallgatót: “and everything under the sun is in tune, but the sun is eclipsed by the moon”. Waters e szavak, valamint az egész dal jelentését azzal magyarázta, hogy azt állította:
Nem tekintem rejtvénynek. Az album a napot és a holdat használja szimbólumként; a fényt és a sötétséget; a jót és a rosszat; az életerőt a halálerővel szemben. Szerintem ez egy nagyon egyszerű kijelentés, amely azt mondja, hogy minden jó dolog, amit az élet kínálhat, ott van számunkra, hogy megragadjuk, de valamilyen sötét erő hatása a természetünkben megakadályozza, hogy megragadjuk őket. A dal a hallgatóhoz szól, és azt mondja, hogy ha rád, a hallgatóra hatással van ez az erő, és ha ez az erő aggaszt téged, nos, én is pontosan ugyanezt érzem. Az “I’ll see you on the dark side of the moon” sorban én beszélek a hallgatóhoz, azt mondom: “Tudom, hogy vannak ezek a rossz érzéseid és késztetéseid, mert nekem is vannak, és az egyik módja annak, hogy közvetlen kapcsolatot teremtsek veled, hogy megosztom veled, hogy néha rosszul érzem magam.”
1:37-nél az Abbey Road Studios portása, Gerry O’Driscoll hallható, aki válaszol a kérdésre: “Mi az a ‘the dark side of the moon’?”: “A Holdnak valójában nincs sötét oldala. Ami azt illeti, az egész sötét. Az egyetlen dolog, ami miatt világosnak tűnik, az a Nap.”
A felvétel legvégén halványan hallható a Beatles “Ticket to Ride” című dalának zenekari változatának egy részlete, amelyet a Hollyridge Strings feldolgozott. Ez nem volt szándékos: a zene az Abbey Roadon szólt a háttérben, amikor Gerry O’Driscoll felvételei készültek. Ez nem szerepel az album 1983-as japán Black Triangle CD-kiadásán; a hangtechnikusok lemásolták az egyik szívdobbanásmintát, eltávolították a zenekari “Ticket to Ride”-ot, többször beillesztették a mintát, és elhalványították az új outrót.