A XVI. században Muzio Tuttavilla gróf csatornázás céljából rekultivációs munkálatokat rendelt el a Sarno folyó völgyében. Az ásatások során Fontana építész a “Collina della Civita” néven ismert területen néhány díszített falú épületet talált. Ezt a leletet dokumentálták, és ennyiben hagyták, a csatorna építési munkálatai pedig folytatódtak. A pompeji ásatások 1748-ban, Bourbon Károly uralkodása alatt kezdődtek újra, miközben a Herculaneumban már folyamatban lévő ásatások szenzációs felfedezéseket hirdettek. A pompeji ásatások monumentális erőfeszítést jelentettek, a forrásokat a valaha végzett legnagyobb ásatási munkálatokra fordították. Néhány rövid megszakítással egészen napjainkig folytatódtak. Mivel Herculaneumot sárlavina borította, az ásatások Pompejiben jobban haladtak, mert sokkal nehezebb volt eltávolítani a megszilárdult sárrétegeket, mint Pompeji hamurétegeit és lapilli köveit kiásni.
A pompeji kutatás iránti érdeklődés akkor kapott új lendületet, amikor 1806 és 1832 között számos, a Forum körüli épületet és néhány előkelő házat találtak. 1860-ban Giuseppe Fiorellit nevezték ki a pompeji régészeti lelőhely igazgatójává, és ő vezette be először azt a módszertant, amely a felfedezést a konzerválás fogalmával ötvözte. Ezt a technikát alkalmazták az összes folyamatban lévő ásatáson, amelyeket ettől kezdve már nem kizárólag az a vágy vezérelt, hogy értékes tárgyakat és fontos épületeket találjanak.
A történelem egyik legnagyobb városának életre keltésének vágya először vezetett racionális és jól megtervezett, házról-házra történő ásatásokhoz. Olyan ásatási technikát vezettek be, amely szerint az ásatásokat a tető szintjén kezdték és rétegről rétegre haladtak lefelé a padló felé, hogy az épületek ne omoljanak ki a korábban feltárt utakra.
A kutatás fontos szakasza következett 1875 és 1893 között Michele Ruggiero építész vezetésével. Számos szigetet tártak fel, valamint számos házat a “REGIO V”, “REGIO VIII” és “REGIO IX” néven ismert területeken, de ami még fontosabb, megkezdődött a házak falain talált több mint ötszáz freskófestmény restaurálása.
A munkálatok Vittorio Spinazzola vezetésével egy kényes szakaszon mentek keresztül, és az 1910 és 1924 között végzett ásatások a város déli területeire összpontosítottak. A cél az volt, hogy feltárják a főút, a Via dell’Abbondanza teljes szakaszát, napvilágra hozva az út mentén álló, az amfiteátrumot a Forummal összekötő épületek homlokzatait. Ez problémákat okozott az épületek homlokzatainak kordában tartásában, mivel azok most a bennük lévő nagy mennyiségű hamu miatt nyomás alá kerültek.
Az a tény továbbá, hogy a kutatók folyamatosan érdekes tárgyakra bukkantak, azt eredményezte, hogy időnként puszta kíváncsiságból elkezdtek ásni a szigetekben, majd elhagyták azokat. Így ma számos olyan házat találunk, amelyet csak részben tártak fel. Aztán jött Amedeo Maiuri régész, aki 1924 és 1961 között számos tárgy felfedezéséért volt felelős, és mindenekelőtt számos tanulmány és alapvető értelmezés szerzője. Neki köszönhető, hogy számos fontos fejezetet írtak a régészet nagy könyvébe, amelyet Pompejinek nevezünk.
Giuseppe Spano, a tudományos élet egyik alakja, aki Maiuri felügyelete alatt a régészeti ásatások igazgatójaként dolgozott, számos olyan munka szerzője volt, amely segített megérteni a Vezúv körüli települések történetét.
A kortárs időszakot nemcsak az új felfedezések jellemzik, hanem a múltban találtak megőrzésével kapcsolatos komoly problémák is (a nemzetgazdaság állapotától függetlenül az olasz állam nagy vonakodást tanúsított, hogy közpénzeket költsön erre a területre ), valamint az, hogy egy interdiszciplináris megközelítés keretében új fejezeteket kell nyitni Pompeji történetében.