メイン州からジョージア州までのアパラチア山脈系は、かつてほぼ全域が森林に覆われていた。 現在でもアパラチア山脈とその周辺地域、特にアパラチア南部には、世界でも有数の広葉樹の落葉樹林が広がっている。 北側には針葉樹（アカエゾマツやバルサムファーは標高の高いところに生育し、カナダやメインの森を特徴づける）、北部の広葉樹（サトウカエデ、バッカイ、ブナ、灰、カバ、レッドオーク、ホワイトオーク）などが生育しています。 さらに南下すると、ヒッコリー、ポプラ、クルミ、スズカケノキ、そしてかつては重要な存在であり、病害虫によって破壊される前は豊富な栗の実がありました。 これらすべてと、アパラチアに生息する140種の樹木が、南部の山岳地帯に生息している。 標高の高い場所ではカナダの森林の代表的なものが育ち、グレートスモーキーの西側斜面では、豊富な降雨量により、最大高さと直径が記録された木が生産されています。
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「アパラチアの森」として知られる南部の植物成長の相互依存システムは非常に複雑である。 それは地球の偉大な花の州の一つを形成しています。 サルスベリ、レッドバッド、サンザシ、チューリップツリー、ハナミズキ、ローカスト、サワーウッドなど、豊かな花を咲かせる木がある。 また、シャクナゲ、ツツジ、マウンテンローレルなど、華やかな花を咲かせる低木も数多くある。 アパラチア山脈南部のいくつかの山頂はヒース・バルドと呼ばれ、ヒースの生い茂る開けた草原や草地が点在しています。 ノースカロライナ州からテネシー州にかけてのユナカスにあるローンマウンテンは、その中でも最も広大な場所の1つで、高い頂上から斜面にかけて、鮮やかなバラやピンクや紫のシャクナゲが広がる約1,200エーカーの自然公園があります。 アパラチア山脈に生息する約2,000種の植物のうち、南アパラチア山脈にしか生息しないものは200種程度と推定されています。
U.S. National Park Service
かつてアパラチア山脈によく見られたバイソン、エルク、オオカミは、その後エルクが北部山岳地帯に戻ってきたものの、かなり前に姿を消しました。 その他の地域には、ツキノワグマ、オジロジカ、イノシシ、キツネ、アライグマ、ビーバー、その他多くの小動物が点在している。 アパラチア地方は、ガスペ半島からジョージア州まで、どの地域も鳥類が豊富である。 グレート・スモーキー山脈だけでも200種類もの狩猟鳥や鳴禽類が記録されている
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