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液体クロマトグラフィー-タンデム質量分析（LC-MS-MS）は、液体クロマトグラフィーが持つ分離能とトリプル四重極質量分析の高感度で選択性の高い質量分析能とを組み合わせた強力な分析技術であります。

目的の分析物を含む試料溶液を、高圧で流れる移動相によって固定相（LCカラム）に送液します。 試料と固定相、移動相の化学的相互作用により、LCカラム内を移動する速度が変化し、分離が行われます。 固定相と移動相の組み合わせは多種多様で、多くの複雑な溶液に適合するように分離をカスタマイズすることができます。 LC/MS/MSシステムの質量分析計にはイオン化源があり、LCカラムの溶出液はネブライジング、脱溶媒、イオン化されて荷電粒子が生成されます。 これらの荷電粒子は、高真空下で電磁場の印加により、一連の質量分析器（四重極）を通過して移動します。 特定の質量/電荷のプリカーサーイオン（または親イオン）が、他の質量/電荷比の粒子を除いて、最初の四重極を通過するようにターゲットが設定されています。 衝突セルでは、選択された質量/電荷イオンは不活性ガスとの衝突によりプロダクトイオン（または娘イオン）に分解される。 第3四重極は、特定のプロダクトイオンの断片をターゲットにするために使用されます。 分離されたプロダクトイオンは、電子増倍管で定量されます。 このプリカーサーからプロダクトイオンへのイオンの遷移（MS2とも呼ばれる）は、目的の化合物の構造に対して非常に特異的であるため、高い選択性が得られます。

この手法の強みは、幅広い化合物に対するLCの分離能と、各対象化合物の固有の質量/電荷（m/z）遷移に基づいて高い感度と選択性で化合物を定量するMSの機能にあります。