Krona, un Oan esiliato, viaggia attraverso il Multiverso e distrugge gli universi alla ricerca della verità sulla creazione. Quando arriva nell’Universo Marvel, il Gran Maestro, desideroso di salvare il suo universo, gli propone di fare un gioco. Se Krona vince, il Gran Maestro lo condurrà da Galactus, un essere di quell’universo che ha assistito alla creazione. Se perde, Krona deve risparmiare l’universo del Gran Maestro. Prima di scegliere i giocatori che parteciperanno a questo gioco, Krona chiede di scambiare i campioni, così i Vendicatori (gli avversari di lunga data di Grandmaster) rappresenteranno Krona e la Justice League (dall’universo di origine di Krona) combatterà per Grandmaster. Questo significa che i Vendicatori devono perdere la partita per salvare il loro universo.
Il Gran Maestro informa la Justice League che per salvare il loro universo, devono raccogliere 12 oggetti di potere – sei per ogni universo – mentre il suo alleato Metron dice ai Vendicatori che devono fare lo stesso per evitare che il loro mondo venga distrutto. I sei oggetti dell’Universo DC sono la Lancia del Destino; il Libro dell’Eternità; il Globo di Ra; la Maschera di Medusa; la Campana, la Giara e la Ruota dei Tre Demoni; e la Batteria del Potere della Lanterna Verde di Kyle Rayner. I sei oggetti dell’Universo Marvel sono l’Ultimate Nullifier; il Evil Eye of Avalon; la Wand of Watoomb; lo Scrigno degli Antichi Inverni; il Cosmic Cube; e l’Infinity Gauntlet.
La Justice League viaggia nell’Universo Marvel e sono costernati (specialmente Superman) dal fallimento dei Vendicatori nel migliorare le condizioni della loro Terra; per esempio, Flash (Wally West) incontra un mutante dall’aspetto non umano che scappa da una folla anti-mutante e Flash lo protegge dalla folla. Convinto che Flash sia un membro degli Accoliti di Magneto, la folla attacca anche lui. Flash scopre anche che la Forza della Velocità (la fonte dei suoi poteri) non esiste in questo universo. Quando i Vendicatori visitano l’Universo DC, sono sorpresi dall’architettura “futuristica” delle sue città terrestri e dagli onori che la Justice League e altri eroi nativi ricevono per le loro gesta. Di conseguenza, essi (soprattutto Capitan America) si convincono che la Justice League è un fascista che esige che i civili li venerino come eroi.
Vari membri della Justice League e dei Vendicatori viaggiano attraverso i due universi e combattono tra loro per recuperare i manufatti del potere. Una battaglia finale per il Cubo Cosmico ha luogo nella Terra Selvaggia dell’Universo Marvel. Dopo un climax, una battaglia di tira e molla, Quicksilver reclama il Cubo Cosmico. In quel momento, Krona e il Gran Maestro arrivano sulla scena, con quest’ultimo che osserva e commenta che il punteggio è pari a 6-6. Tuttavia, Batman e Capitan America – che insieme hanno indagato la causa della gara e scoperto la sua vera natura e la posta in gioco – arrivano. Capitan America lancia volutamente il suo scudo e bussa il Cubo dalle mani di Quicksilver, permettendo a Batman di prenderlo. Con la rinuncia di Capitan America del Cubo Cosmico, il Gran Maestro ora annuncia la Justice League come i vincitori, con il punteggio finale ora è 7-5. Tuttavia, Krona non è disposto ad accettare la sconfitta, e attacca il Gran Maestro, forzando l’identità di Galactus da lui. Poi convoca Galactus e cerca di estrarre informazioni sull’origine dell’universo. Il Gran Maestro usa il potere degli artefatti e fonde entrambi gli universi insieme prima che Krona possa fare a pezzi Galactus.
La realtà è alterata in modo tale che la Justice League e i Vendicatori sono ora alleati di lunga data, viaggiando regolarmente tra i mondi per combattere varie minacce. Inoltre, i membri della JLA morti da tempo, Flash (Barry Allen) e Lanterna Verde (Hal Jordan) sono riapparsi. Ma gli universi sono incompatibili l’uno con l’altro e cominciano a distruggere se stessi e l’altro, con la gente che passa da un mondo all’altro. Un effetto collaterale di questo è che Superman e Capitan America diventano paranoici, irritabili e irascibili; le loro emozioni si infiammano al punto che si incolpano a vicenda per tutto ciò che sta accadendo (questo viene poi spiegato come entrambi gli eroi siano troppo fortemente sincronizzati ai loro universi nativi). L’apparizione di un Krona spettrale aiuta gli eroi a ricordare una parte del concorso e scoprono cosa sta succedendo ai loro mondi. Lo Straniero Fantasma appare per condurre gli eroi dal Gran Maestro.
Forzato dall’attacco di Krona, il Gran Maestro spiega come ha riunito gli universi per imprigionare Krona usando i 12 oggetti, ma Krona sta fondendo ulteriormente gli universi per distruggerli, sperando di creare un nuovo Big Bang, al quale può sopravvivere e finalmente conoscerne i misteri. Prima di morire, il Gran Maestro chiede agli eroi riuniti di fermare Krona e ristabilire l’ordine. Su insistenza di Capitan America, rivela vari eventi che hanno avuto luogo negli universi separati per mostrare agli eroi per quali tipi di mondi stanno combattendo. Ogni membro della squadra è testimone delle tragedie che li hanno colpiti nei loro universi separati, come la morte di Barry Allen, la discesa nel male di Hal Jordan e la perdita dei figli di Visione e della Strega Scarlatta. Alcuni degli eroi contemplano l’idea di lasciare gli universi così come sono per evitare che le tragedie accadano, ma Hal Jordan ispira tutti a lavorare per il bene dei loro mondi.
Krona ha intrappolato gli avatar universali di Eternity e Kismet mentre la realtà continua a cambiare. Ha scoperto che negli universi esiste una sensibilità e intende costringere i loro spiriti a uscire, consegnandogli i loro segreti. Entrambe le squadre di eroi riconciliano le loro differenze l’una con l’altra e fanno piani per fermare Krona. Invadendo la base interdimensionale di Krona, Capitan America guida ogni eroe che sia mai stato membro della Justice League o dei Vendicatori. Il caos cronico alla base fa sì che un gruppo sempre diverso di eroi affronti tutti i cattivi che le squadre abbiano mai combattuto con i cattivi che sono stati mentalmente incantati da Krona. Anche se il caos e le forze contro di loro (sia da Krona che dai cattivi evocati) fanno sì che gli eroi cadano uno per uno lungo la strada, Krona viene infine sconfitto quando il Flash lo distrae abbastanza a lungo per Occhio di Falco per sparare una freccia esplosiva nella macchina che ha usato per mantenere entrambi i mondi fusi, dopo di che il Flash prende gli oggetti del potere – entrambi gli eroi essendo stati precedentemente presunti morti in battaglia. Krona viene poi risucchiato nel vortice in formazione.
Le Terre vengono separate con l’aiuto della Spectre (che in questo momento è Hal Jordan, ora riportato al suo stato attuale) e gli universi vengono riportati ai loro stati normali. Mentre gli eroi di entrambi gli universi tornano al loro posto, affermano che, sia che facciano troppo poco o troppo, sono ancora eroi che combatteranno sempre la buona battaglia. Krona è imploso per formare un uovo cosmico, che è conservato nella Torre di Guardia della JLA; Metron afferma che quando l’uovo si schiude, Krona imparerà i segreti della creazione del suo universo facendone parte. Metron e il Grandmaster appena risorto discutono di come Metron abbia intenzionalmente attirato Krona nell’Universo Marvel. Il Gran Maestro dice che questa è la prima partita che abbia mai giocato in cui tutte le parti hanno vinto (il Gran Maestro attraverso la battaglia tra la Justice Leaguers e i Vendicatori, gli eroi salvando i loro universi, e Krona ottenendo alla fine le risposte che cercava).