No século XVI o Conde Muzio Tuttavilla encomendou obras de recuperação no vale do rio Sarno com o objectivo de escavar um canal. Durante as escavações, o arquitecto Fontana encontrou alguns edifícios com paredes decoradas na zona conhecida como ‘Collina della Civita’. Este achado foi documentado e deixado assim, e as obras no canal continuaram. As escavações em Pompeia recomeçaram em 1748 sob o reinado de Carlos de Bourbon, enquanto as escavações já em curso em Herculaneum anunciavam descobertas sensacionais. As escavações em Pompéia foram um esforço monumental, com recursos canalizados para o maior trabalho de escavação jamais realizado. Com algumas breves interrupções, continuou até os dias de hoje. Como o Herculano estava coberto por um deslizamento de lama, os trabalhos de escavação progrediram melhor em Pompeia porque era muito mais difícil remover a manta endurecida de lama solidificada do que desenterrar Pompeia das camadas de cinzas e pedras de lapilli.
Interesse na pesquisa em Pompeia foi dado novo vigor quando muitos dos edifícios ao redor do Fórum e algumas das casas de prestígio foram encontradas entre 1806 e 1832.
Em 1860 Giuseppe Fiorelli foi nomeado diretor do sítio arqueológico em Pompeia e ele introduziu pela primeira vez uma metodologia que combinava a descoberta com o conceito de conservação. Esta técnica foi aplicada a todas as escavações em curso, que a partir de então já não se inspiravam apenas no desejo de encontrar objectos preciosos e edifícios importantes.
Pela primeira vez o desejo de trazer de volta à vida uma das maiores cidades da história levou a escavações racionais e bem planeadas de casa para casa. Uma técnica de escavação, em que as escavações começaram ao nível do telhado e se deslocaram para baixo, camada a camada, foi introduzida para evitar que os edifícios desabassem para fora nas estradas previamente escavadas.
Uma importante fase de pesquisa seguiu-se entre 1875 e 1893 sob a direcção do arquitecto Michele Ruggiero. Muitas insulações foram descobertas, assim como numerosas casas nas áreas conhecidas como ‘REGIO V’, ‘REGIO VIII’ e ‘REGIO IX’ mas, mais importante, os trabalhos de restauração começaram em mais de quinhentas pinturas a fresco encontradas nas paredes das casas.
Os trabalhos passaram por uma fase delicada sob a direção de Vittorio Spinazzola e as escavações realizadas entre 1910 e 1924 concentraram-se nas áreas do sul da cidade. O objetivo era de desenterrar todo o trecho da estrada principal, Via dell’Abbondanza, trazendo à luz as fachadas dos edifícios ao longo da estrada e unindo o Anfiteatro ao Fórum. Isto causou problemas na contenção das fachadas dos edifícios, que agora estavam sob pressão das grandes quantidades de cinzas dentro deles.
Outras vezes, o facto de os investigadores encontrarem continuamente artigos interessantes significava que por vezes começavam a escavar as insuldades por pura curiosidade e depois abandonavam-nas. Assim, hoje encontramos várias casas que foram apenas parcialmente escavadas. Depois veio o arqueólogo Amedeo Maiuri que foi responsável pela descoberta de muitos itens entre 1924 e 1961 e, sobretudo, o autor de numerosos estudos e interpretações fundamentais. É graças a ele que muitos capítulos importantes foram escritos no grande livro de arqueologia que chamamos Pompeia.
Giuseppe Spano, figura do mundo acadêmico que trabalhou como diretor das escavações arqueológicas durante a superintendência de Maiuri, foi o autor de muitas obras que ajudaram a entender a história dos assentamentos em torno do Monte Vesúvio.
O período contemporâneo caracterizou-se não só por novas descobertas, mas também por sérios problemas relativos à preservação do que foi encontrado no passado (independentemente do estado da economia nacional, o Estado italiano mostrou grande relutância em gastar dinheiro público neste sector), e pela necessidade de abrir novos capítulos na história de Pompeia como parte de uma abordagem interdisciplinar.