Melatonin je hormon produkovaný epifýzou, který hraje roli v regulaci spánku a cirkadiánního rytmu a také možnou roli v signalizaci mezi střevy a mozkem. Je běžnou součástí mateřského mléka, přičemž jeho koncentrace je vyšší v nočních hodinách (maximum kolem třetí hodiny ranní) než ve dne. Elektivní císařský řez má za následek vyšší denní hladiny kolostra než při vaginálním porodu. Někteří autoři navrhují, aby matky kojily v noci za tmy, aby se zabránilo snížení obsahu melatoninu v mateřském mléce, které by mohlo narušit spánkový režim kojence. Rozlišování mléka odsávaného během dne a mléka odsávaného za tmy bylo navrženo i pro ženy, které odsávají mléko pro své kojence. Některé studie připisují melatoninu v mateřském mléce delší dobu spánku u kojených dětí než u dětí krmených umělou výživou. Jiná studie zjistila vyšší hladiny melatoninu v mlezivu v noci, což zřejmě zvyšuje fagocytární aktivitu buněk mleziva proti bakteriím. Exogenní podávání melatoninu nemá během kojení žádné specifické využití a neexistují žádné údaje o bezpečnosti užívání melatoninu matkami během kojení. Dávky vyšší, než jaké se očekávají v mateřském mléce po suplementaci matkou, však byly u kojenců bezpečně použity. Není pravděpodobné, že by krátkodobé užívání obvyklých dávek melatoninu ve večerních hodinách kojící matkou mělo nepříznivý vliv na kojené dítě, i když někteří autoři jeho užívání při kojení nedoporučují z důvodu nedostatku údajů a relativně dlouhého poločasu u nedonošených novorozenců.
Doplňky stravy nevyžadují rozsáhlé schválení před uvedením na trh ze strany amerického Úřadu pro kontrolu potravin a léčiv. Výrobci jsou odpovědní za zajištění bezpečnosti, ale nemusí prokazovat bezpečnost a účinnost doplňků stravy před jejich uvedením na trh. Doplňky stravy mohou obsahovat více složek a často se vyskytují rozdíly mezi označenými a skutečnými složkami nebo jejich množstvím. Výrobce může uzavřít smlouvu s nezávislou organizací, která ověří kvalitu výrobku nebo jeho složek, ale tím není potvrzena bezpečnost nebo účinnost výrobku. Vzhledem k výše uvedeným problémům nemusí být výsledky klinického testování jednoho výrobku použitelné pro jiné výrobky. Podrobnější informace o doplňcích stravy jsou k dispozici na jiném místě webových stránek společnosti LactMed.