Krona, wygnany Oan, podróżuje przez Multiwersum i niszczy wszechświaty, szukając prawdy o stworzeniu. Kiedy przybywa do Marvel Universe, Grandmaster – chcąc ocalić swój wszechświat – proponuje, by zagrali w grę. Jeśli Krona wygra, Grandmaster doprowadzi go do Galactusa, istoty w tym wszechświecie, która była świadkiem stworzenia. Jeśli przegra, Krona musi ocalić wszechświat Wielkiego Mistrza. Przed wyborem graczy, którzy wezmą udział w tej grze, Krona żąda zamiany mistrzów, więc Avengers (odwieczni przeciwnicy Wielkiego Mistrza) będą reprezentować Kronę, a Liga Sprawiedliwości (z rodzinnego wszechświata Krony) będzie walczyć dla Wielkiego Mistrza. Oznacza to, że Avengers muszą przegrać grę, aby zapisać ich universe.
The Grandmaster informuje Liga Sprawiedliwości, że aby zapisać ich wszechświat, muszą zebrać 12 elementów władzy-sześć z każdego wszechświata, a jego sojusznik Metron mówi Avengers, że muszą zrobić to samo, aby zapobiec ich świat od zniszczenia. Sześć przedmiotów z uniwersum DC to Włócznia Przeznaczenia, Księga Wieczności, Kula Ra, Maska Meduzy, Dzwon, Słój i Koło Trzech Demonów oraz Bateria Mocy Zielonej Latarni Kyle’a Raynera. Sześć przedmiotów z Uniwersum Marvela to Ultimate Nullifier, Evil Eye of Avalon, Wand of Watoomb, Casket of Ancient Winters, Cosmic Cube i Infinity Gauntlet.
The Justice League podróżuje do Marvel Universe i są przerażeni (zwłaszcza Superman) przez Avengers 'niepowodzenia w poprawie ich stan Ziemi, na przykład, Flash (Wally West) napotyka non-human-looking mutant uciekając od anty-mutant tłumu i Flash chroni go od tłumu. Przekonany, że Flash jest członkiem Magneto’s Acolytes, tłum atakuje go, jak również. Flash odkrywa również, że Speed Force (źródło jego uprawnień) nie istnieje w tym wszechświecie. Kiedy Avengers odwiedzają DC Universe, są zaskoczeni „futurystyczną” architekturą jego ziemskich miast oraz honorami, jakie Justice League i inni rodzimi bohaterowie otrzymują za swoje czyny. W rezultacie, oni (głównie Captain America) stają się przekonani, że Liga Sprawiedliwości to faszyści, którzy żądają, aby cywile hero-worship them.
Various Justice League i Avengers członkowie podróżują przez dwa wszechświaty i walczyć ze sobą, aby odzyskać artefakty władzy. Ostateczna bitwa o Cosmic Cube ma miejsce w Savage Land z Marvel Universe. Po kulminacyjnym, back-and-forth bitwy, Quicksilver twierdzi Cosmic Cube. W tym momencie, Krona i Grandmaster przybyć na scenę, z tym ostatnim obserwuje i komentuje, że wynik jest nawet na 6-6. Jednak Batman i Captain America – którzy wspólnie zbadali przyczynę konkursu i odkryli jego prawdziwą naturę i stawkę – przybywają na miejsce. Kapitan Ameryka celowo rzuca swoją tarczę i wytrąca kostkę z rąk Quicksilvera, pozwalając Batmanowi ją złapać. Po utracie Kosmicznej Kostki przez Kapitana Amerykę, Wielki Mistrz ogłasza Ligę Sprawiedliwości zwycięzcami, a ostateczny wynik wynosi 7-5. Jednak Krona nie chce zaakceptować porażkę, i atakuje Grandmaster, zmuszając tożsamość Galactus od niego. On następnie przywołuje Galactus i próbuje wydobyć informacje na temat pochodzenia wszechświata. Grandmaster wykorzystuje moc artefaktów i łączy oba wszechświaty razem przed Krona może rozerwać Galactus apart.
Reality jest zmieniony tak, że Liga Sprawiedliwości i Avengers są teraz długoletni sojusznicy, regularnie podróżuje między światami do walki z różnymi zagrożeniami. Ponadto, dawno zmarłych członków JLA Flash (Barry Allen) i Green Lantern (Hal Jordan) pojawiły się ponownie. Ale wszechświaty są niekompatybilne ze sobą i zaczynają niszczyć siebie i siebie nawzajem, z ludźmi przełączającymi się między światami. Jednym z efektów ubocznych tego jest to, że Superman i Kapitan Ameryka stają się paranoidalne, drażliwy, i short-tempered; ich emocje flare do punktu, w którym obwiniają się nawzajem za wszystko, co się dzieje (to jest później wyjaśnione jako obu bohaterów jest zbyt mocno zsynchronizowane z ich rodzimych wszechświatów). Pojawienie się widmowego Krona pomaga bohaterom pamiętać niektóre z konkursu i dowiadują się, co dzieje się z ich światów. Phantom Stranger pojawia się, aby doprowadzić bohaterów do Grandmaster.
Osłabiony przez atak Krona, Grandmaster wyjaśnia, jak on przyniósł wszechświatów razem uwięzić Krona za pomocą 12 przedmiotów, ale Krona łączy wszechświaty dalej, aby je zniszczyć, mając nadzieję na stworzenie nowego Big Bang, który może przetrwać i wreszcie dowiedzieć się jego tajemnice. Przed śmiercią, Grandmaster prosi zebranych bohaterów, aby zatrzymać Krona i przywrócić porządek. Na nalegania Kapitana Ameryki, on ujawnia różne wydarzenia, które miały miejsce w oddzielnych wszechświatów, aby pokazać bohaterom, co rodzaje światów są one walczą. Każdy członek zespołu jest świadkiem tragedii, które spadły na nich w ich oddzielnych wszechświatów, takich jak śmierć Barry’ego Allena, Hal Jordan zejście do zła, a utrata Vision i Scarlet Witch dzieci. Niektórzy bohaterowie rozważają pozostawienie wszechświatów, jak są, aby zapobiec tragedii z happeningiem, ale Hal Jordan inspiruje wszystkich do pracy dla dobra ich worlds.
Krona ma uwięziony uniwersalne awatary wieczności i Kismet jak rzeczywistość nadal się zmieniać. Odkrył, że sentience istnieje we wszechświatach i zamierza zmusić ich duchy na zewnątrz, dając mu swoje tajemnice. Obie drużyny bohaterów pogodzić swoje różnice ze sobą i zrobić plany, aby zatrzymać Krona. Invading Krona międzywymiarowej bazy, Kapitan Ameryka prowadzi każdy bohater, który kiedykolwiek był członkiem Ligi Sprawiedliwości lub Avengers. Chroniczny chaos w bazie powoduje stale zmieniający się spis bohaterów, aby skonfrontować każdy złoczyńca, którego zespoły kiedykolwiek walczyli z złoczyńcami, które zostały psychicznie zachwycony Krona. Nawet jeśli chaos i czyste siły przeciwko nim (zarówno z Krona i wezwanych złoczyńców) spowodować bohaterów do upadku jeden po drugim w drodze, Krona jest ostatecznie pokonany, gdy Flash rozprasza go na tyle długo, aby Hawkeye strzelać wybuchową strzałę do maszyny użył zachować oba światy połączone, po którym Flash bierze elementy władzy, obaj bohaterowie byli wcześniej przypuszczalnie martwy w walce. Krona jest następnie zasysane do tworzącego się vortex.
The Earths są oddzielone z pomocą Spectre (który w tym czasie jest Hal Jordan, teraz przywrócony do jego obecnego stanu) i wszechświaty są zwracane do ich normalnych stanów. Jak bohaterowie z obu wszechświatów wrócić do swoich właściwych miejsc, potwierdzają, że czy robią zbyt mało lub zbyt wiele, są one nadal bohaterami, którzy zawsze będą walczyć dobrą walkę. Krona implodował, aby utworzyć kosmiczne jajo, które jest przechowywane w Strażnicy JLA; Metron stwierdza, że kiedy jajo wykluwa się, Krona pozna tajemnice tworzenia swojego wszechświata, będąc jego częścią. Metron i nowo wskrzeszony Grandmaster dyskutują o tym, jak Metron celowo zwabił Kronę do Marvel Universe. Grandmaster mówi, że to pierwsza gra, w którą kiedykolwiek grał, gdzie wszystkie strony wygrały (Grandmaster poprzez bitwę pomiędzy Justice Leaguers i Avengers, bohaterowie poprzez uratowanie ich wszechświatów, a Krona poprzez ostateczne zdobycie odpowiedzi, których szukał).