As nogueiras pretas são consideradas tóxicas, mas são únicas da maioria das outras plantas tóxicas. São seguras para todos os animais, excepto cavalos, e os cavalos são geralmente afectados apenas por aparas feitas da árvore. As nogueiras pretas são, no entanto, tóxicas para algumas espécies de plantas se crescerem dentro de uma determinada área da árvore. Em menos casos, o derrame de pólen pode causar reacções alérgicas em cavalos e pessoas, bem como efeitos renais em animais que ingerem cascas.
As nogueiras pretas são fáceis de identificar pelas grandes nozes redondas que caem após a queda das folhas no Outono. São árvores grandes com casca marrom escura que é profundamente sulcada. As folhas são longas e pontiagudas. As nozes pretas são bastante comuns em Maryland e podem viver até 250 anos. São as árvores de nozes mais comumente plantadas na América do Norte, em parte porque a maioria das plântulas germina de nozes enterradas por esquilos.
As raízes da nogueira negra produzem um composto orgânico chamado juglone. O juglone tem um efeito alelopático em algumas outras plantas, o que significa que pode retardar o seu crescimento ou mesmo impedi-lo de crescer. O juglone tem o seu efeito perturbando a capacidade de uma planta de trocar dióxido de carbono e oxigénio. Nem todas as espécies de plantas são afectadas negativamente por este composto: pastagens e gramíneas crescem na presença de juglone, mas muitas flores, vegetais e algumas espécies de árvores e arbustos não o farão. O juglone está presente nas folhas, raízes, cascas e frutos e pode ser encontrado no solo em toda a zona radicular da árvore (em média 50 a 80 pés de diâmetro para uma árvore madura). Os efeitos alelopáticos não são geralmente observados até que a árvore tenha pelo menos sete anos de idade.
Juglone não representa nenhuma ameaça de toxicidade para os seres humanos, mas os jardineiros devem estar cientes dos seus efeitos e planear em conformidade. A utilização de canteiros elevados forrados com tecido de jardinagem pode tornar possível o crescimento de plantas susceptíveis nas proximidades de nogueiras negras. O Juglone decompõe-se quando é compostado. Se forem usadas folhas, galhos ou nozes pretas no composto para serem espalhadas num jardim, o composto deve ser envelhecido pelo menos um ano antes de ser aplicado.
Cavalos podem ser afectados pelas nozes pretas se forem usadas aparas feitas da árvore na cama. Apenas 20% de nogueira preta em aparas ou serradura pode causar sinais clínicos dentro de horas de contacto. Os efeitos da exposição afetam principalmente o membro inferior e incluem a estocagem, a marcha rígida e a relutância em se mover. Se não for tratada, a toxicosis pode progredir e causar cólicas, inchaço do pescoço e do peito, aumento do ritmo cardíaco e respiratório, e até mesmo laminite e fundadora. Os sinais clínicos geralmente desaparecem quando a roupa de cama é removida. A melhor maneira de prevenir problemas é garantir que a roupa de cama não contenha noz preta. As aparas de nozes pretas são bastante escuras e contrastam facilmente com as aparas de pinheiro de cor clara. Outras espécies animais não são afectadas.
Juglone, o produto químico alelopático produzido pela nogueira preta, era originalmente suspeito como o composto tóxico nas aparas e serradura. Contudo, os pesquisadores não foram capazes de reproduzir os efeitos tóxicos quando a juglone é isolada e administrada por via dérmica (sobre a pele) ou oral (por ingestão). Assim, o composto tóxico que causa esses sintomas em cavalos ainda é desconhecido.
Nogueira Preta pode causar outros problemas, embora estes sejam relatados com muito menos freqüência do que os dois descritos acima. Algumas pessoas e cavalos são especialmente sensíveis ao pólen da noz preta e podem sofrer de reações alérgicas quando o pólen é derramado na primavera. Além disso, as cascas que rodeiam as nozes caídas podem tornar-se tóxicas à medida que começam a decompor-se. O bolor do penicillium afecta a casca em decomposição e produz uma neurotoxina chamada Penitrem A, que é tóxica para o gado e pode ser fatal para os cães. As pessoas também devem ter cuidado; as nozes pretas são comestíveis mas podem ser contaminadas com Penitrem A se os cascos começarem a decompor-se antes de as nozes serem colhidas.