În secolul al XVI-lea, contele Muzio Tuttavilla a comandat lucrări de recuperare în valea râului Sarno cu scopul de a săpa un canal. În timpul săpăturilor, arhitectul Fontana a descoperit câteva clădiri cu pereți decorați în zona cunoscută sub numele de ‘Collina della Civita’. Această descoperire a fost documentată și lăsată așa, iar lucrările la canal au continuat. Săpăturile din Pompei au reînceput în 1748, sub domnia lui Carol de Bourbon, în timp ce săpăturile deja începute la Herculaneum anunțau descoperiri senzaționale. Săpăturile de la Pompei au reprezentat un efort monumental, resursele fiind canalizate către cele mai mari lucrări de excavare efectuate vreodată. Cu câteva scurte întreruperi, aceasta a continuat până în prezent. Întrucât Herculaneum a fost acoperit de o alunecare de noroi, lucrările de excavare au progresat mai bine la Pompei, deoarece a fost mult mai greu să se îndepărteze pătura întărită de noroi solidificat decât să se scoată Pompeiul din straturile de cenușă și pietre de lapilli.
Interesul pentru cercetările de la Pompei a căpătat un nou avânt atunci când multe dintre clădirile din jurul Forumului și unele dintre casele de prestigiu au fost descoperite între 1806 și 1832.
În 1860, Giuseppe Fiorelli a fost numit director al sitului arheologic de la Pompei și a introdus pentru prima dată o metodologie care combină descoperirea cu conceptul de conservare. Această tehnică a fost aplicată tuturor săpăturilor în curs de desfășurare, care de atunci încolo nu au mai fost inspirate doar de dorința de a găsi obiecte prețioase și clădiri importante.
Pentru prima dată, dorința de a readuce la viață unul dintre cele mai mari orașe ale istoriei a dus la săpături raționale și bine planificate, casă cu casă. A fost introdusă o tehnică de săpătură, prin care săpăturile începeau de la nivelul acoperișului și coborau spre podea strat cu strat, pentru a preveni prăbușirea clădirilor spre exterior pe drumurile excavate anterior.
A urmat o fază importantă de cercetare între 1875 și 1893, sub conducerea arhitectului Michele Ruggiero. Au fost descoperite multe insule, precum și numeroase case din zonele cunoscute sub numele de „REGIO V”, „REGIO VIII” și „REGIO IX”, dar, mai important, au început lucrările de restaurare a peste cinci sute de picturi în frescă găsite pe pereții caselor.
Lucrările au trecut printr-o fază delicată sub conducerea lui Vittorio Spinazzola, iar săpăturile efectuate între 1910 și 1924 s-au concentrat pe zonele sudice ale orașului. Scopul acestora a fost acela de a dezgropa întreaga porțiune a drumului principal, Via dell’Abbondanza, scoțând la lumină fațadele clădirilor aflate de-a lungul drumului și care uneau Amfiteatrul cu Forumul. Acest lucru a cauzat probleme în ceea ce privește izolarea fațadelor clădirilor, deoarece acestea se aflau acum sub presiunea cantităților mari de cenușă din interiorul lor.
În plus, faptul că cercetătorii găseau continuu obiecte interesante a însemnat că, uneori, începeau să sape în insule din pură curiozitate și apoi le abandonau. Astfel, astăzi găsim mai multe case care au fost excavate doar parțial. Apoi a venit arheologul Amedeo Maiuri, care a fost responsabil pentru descoperirea a numeroase obiecte între 1924 și 1961 și, mai ales, autorul a numeroase studii și interpretări fundamentale. Datorită lui au fost scrise multe capitole importante în marea carte a arheologiei pe care o numim Pompei.
Giuseppe Spano, o figură din lumea academică care a lucrat ca director al săpăturilor arheologice în timpul superintendenței lui Maiuri, a fost autorul a numeroase lucrări care au ajutat la înțelegerea istoriei așezărilor din jurul Muntelui Vezuviu.
Perioada contemporană a fost caracterizată nu numai de noi descoperiri, ci și de probleme serioase în ceea ce privește conservarea a ceea ce a fost găsit în trecut (indiferent de starea economiei naționale, statul italian s-a arătat foarte reticent în a cheltui bani publici în acest sector ), precum și de necesitatea de a deschide noi capitole în istoria Pompeiului ca parte a unei abordări interdisciplinare.
.