Atheris squamigera raggiunge una lunghezza totale media (corpo + coda) di 46-60 cm (circa 18-24 pollici), con una lunghezza totale massima che a volte supera i 78 cm (circa 31 pollici). Le femmine sono solitamente più grandi dei maschi.
La testa è larga e piatta, distinta dal collo. La bocca ha una bocca molto grande. La testa è fittamente coperta di squame carenate e imbricate. La squama rostrale non è visibile dall’alto. Una scaglia molto piccola appena sopra la rostrale è affiancata da scaglie molto grandi su entrambi i lati. Le narici sono laterali. L’occhio e il naso sono separati da 2 scaglie. Sulla parte superiore della testa, ci sono da 7 a 9 scaglie interorbitali. Ci sono da 10 a 18 scaglie circumorbitali. Ci sono 2 (raramente 1 o più di 2) file di scaglie che separano gli occhi dalle labiali. Ci sono da 9 a 12 sopralabiali e da 9 a 12 sublabiali. Di queste ultime, le 2 o 3 anteriori toccano gli scudi del mento, di cui esiste solo un piccolo paio. Le scaglie golari sono carenate.
A metà corpo ci sono da 15 a 23 file di scaglie dorsali, da 11 a 17 posteriormente. Ci sono da 152 a 175 scaglie ventrali e da 45 a 67 subcaudali indivise. È possibile che ci sia una variazione dei caratteri morfometrici legata all’habitat:
| Foreste meridionali | Pascoli settentrionali | |
| Righe dorsali del corpo centrale | 17 | 21 |
| Scaglie ventrali | 171 | 168 |
| Scaglie subcaudali | 52 | 58 |
La colorazione è uguale in alcune popolazioni, ma variabile in altre. Il colore dorsale varia dal verde salvia o verde chiaro al verde, verde scuro, bluastro, oliva o marrone oliva scuro. Si possono trovare rari esemplari che sono gialli, rossastri o grigio ardesia. Le squame hanno chiglie chiare e talvolta punte gialle che formano una serie di 30 o più bande trasversali chiare o chevrons. Sulla coda, ci sono da 10 a 19 chevrons: non sempre chiaramente definiti, ma solitamente presenti. Il bordo ventrale del dorso presenta macchie chiare a coppie. Un colore nero interstiziale è visibile solo quando la pelle è stirata. Il ventre è giallo o da spento a olivastro pallido; può essere di colore uniforme o fortemente chiazzato di macchie nerastre. La gola è talvolta gialla. La coda ha una vistosa punta bianco avorio, lunga da 7 a 12 mm, che si estende all’indietro oltre le 10 subcaudali.
I neonati hanno una colorazione oliva scura con barre ondulate, oliva più chiara o oliva giallastra con sottili margini oliva scura, barre a intervalli di 5 mm, e un ventre che è più chiaro oliva verdastro. Il modello di colore adulto si sviluppa entro 3 o 4 mesi.