Profissionais de odontologia holística ou biológica podem variar muito em termos das técnicas e serviços que oferecem. Enquanto muitos dentistas convencionais reconhecem que existe um mérito significativo para diferentes abordagens preventivas da odontologia, alguns destes dentistas criticaram práticas holísticas por falta de eficácia de abordagem e falso marketing em suas práticas.
Uma parte significativa da crítica da odontologia holística está relacionada ao uso infundado de certos serviços e tratamentos, muitos dos quais foram investigados e considerados ineficazes, ou não foram pesquisados o suficiente para serem declarados seguros e eficazes para a prática. Por exemplo, os remédios fitoterápicos são frequentemente recomendados sob a forma de colutório e pasta de dentes para prevenir ou tratar certas condições dentárias. São produtos supostamente mais seguros porque são “naturais”. No entanto, existe uma falta de investigação científica que suporte tais tratamentos e, de facto, descobriu-se que os remédios herbais têm impacto na segurança de procedimentos dentários mais invasivos ou prolongados, e podem levar a complicações adicionais se interagirem com os medicamentos actuais de um paciente. No entanto, algumas técnicas dentárias tradicionais à base de ervas, como o uso do bastão Miswak, demonstraram ser de possível eficácia. No entanto, o domínio da higiene dentária à base de ervas continua a ser um domínio pouco estudado, e serão necessárias mais avaliações científicas rigorosas para determinar a eficácia de diferentes métodos.
Alguns críticos da prática da odontologia holística também notam que os honorários cobrados por tais profissionais são geralmente várias vezes mais elevados do que os dos dentistas convencionais. Alguns afirmam que a odontologia alternativa é meramente a exploração de crenças e artifícios de nicho de saúde para justificar honorários mais elevados. Um exemplo potencial disso é o Cavitat, um dispositivo de ultra-som não validado, supostamente capaz de detectar alegadas lesões descritas como “cavitações” (ver: osteonecrose cavitacional induzida por neuralgia), ou a utilização não baseada em evidências de aparelhos respiratórios por certos “dentistas biológicos” durante a remoção de preenchimentos de amálgama, destinados a reduzir a toxicidade do mercúrio através da eliminação de material inalado pelo ar. Entretanto, outros argumentam que tais práticas não são representativas de todo o campo da odontologia holística.