I preti missionari celebrarono per la prima volta la messa a Franklin nel 1821 in una casa privata per le due famiglie cattoliche residenti. La diocesi di Nashville pianificò una chiesa cattolica nella contea di Williamson già nel 1843, ma fu l’afflusso di lavoratori irlandesi cattolici delle ferrovie dopo la guerra civile che stimolò lo sforzo di stabilire la chiesa cattolica di San Filippo nel 1871. I lavoratori modellavano e cuocevano a mano i mattoni della chiesa sul posto e facevano tutta la costruzione da soli. Il pastore P. John Nolan era un talentuoso intagliatore di legno che decorò sia la chiesa che la canonica con le sue sculture negli anni 1890. Nel 1921, in occasione del Giubileo d’Oro, i discendenti di molti dei fondatori della chiesa donarono le vetrate. La crescita negli anni ’70 ha reso necessaria la serie di edifici che vedete oggi, comprendente quattro santuari separati, tutti costruiti tra il 1976 e il 1997. Oggi il santuario principale è stato ricavato da una ex banca sulla Main Street all’altezza della 1st Avenue e l’edificio originale serve da cappella. Prima della chiesa, la proprietà era di proprietà di John Eaton, un avvocato di Franklin, senatore degli Stati Uniti e segretario alla guerra sotto il presidente Andrew Jackson. Eaton e sua moglie Peggy furono coinvolti in uno scandalo che fece quasi cadere l’amministrazione Jackson.