Alfa uhlík je centrálním bodem všech aminokyselin. Zde zobrazený segment je spojen s dalšími dvěma peptidovými vazbami. (Pohled na tyčinku + polární H, zbarvení EnzDes.)
Uhlík alfa je centrálním bodem v páteři každé aminokyseliny.
Uhlík alfa (α-uhlík nebo Cα) je tím, co spojuje aminoskupinu s karboxylovou skupinou kyseliny a dává aminokyselinám jejich název.
Uhlík alfa slouží také jako místo připojení postranních řetězců 19 z 20 aminokyselin používaných při stavbě bílkovin.
Glycin je jediná aminokyselina bez postranního řetězce. V glycinu zaujímá atom vodíku místo, kde je v ostatních aminokyselinách připojen postranní řetězec k alfa uhlíku.
Uhlík alfa má také vodík připojený naproti postrannímu řetězci. (Nebo v případě glycinu má vodík připojený naproti vodíku, který nahrazuje postranní řetězec.)
Uhlík alfa je vždy atom 2.
Rozdíl mezi jednotlivými segmenty se často uvádí jako vzdálenost mezi uhlíky alfa.
Ve Folditu se pásek vytažený k páteři nebo z ní ve skutečnosti připojuje k uhlíku alfa. Funkce pro tvorbu pásů, jako je band.AddBetweenSegments, používají alfa uhlík (atom 2) jako výchozí atom, pokud není zadán jiný atom.
Bod řezu Foldit dočasně přeruší peptidovou vazbu mezi dvěma segmenty. „Řezný pásek“ spojuje alfa uhlíky obou segmentů, dokud není řezný bod uzavřen.
Podrobněji o zde uvedených komponentách páteře viz proteinová páteř.