Alpha-kulstoffet er det centrale punkt i alle aminosyrer. Det segment, der er vist her, er forbundet med to andre ved hjælp af peptidbindinger. (Stick + polar H view, EnzDes farvelægning.)
Alfakulstoffet er det centrale punkt i rygsøjlen i alle aminosyrer.
Alfakulstoffet (α-kulstof eller Cα) er det, der forbinder aminogruppen med syrens carboxylgruppe, hvilket giver aminosyrerne deres navn.
Alfakulstoffet tjener også som fastgørelsespunkt for sidekæderne i 19 ud af 20 aminosyrer, der bruges i proteinopbygningen.
Glycin er den eneste aminosyre uden sidekæde. I glycin tager et hydrogenatom det sted, hvor en sidekæde er knyttet til alfa-kulstoffet i de andre aminosyrer.
Alfakulstoffet har også et hydrogen, der er knyttet over for sidekæden. (Eller, i glycinets tilfælde, har det et hydrogen over for det hydrogen, der erstatter sidekæden.)
Alfakulstoffet er altid atom 2.
Segment-til-segmentforskelle rapporteres ofte som afstanden mellem alfakulstofferne.
I Foldit forbinder et bånd, der er trukket til eller fra backbone, i realiteten alfakulstoffet. Banding-funktionerne, som f.eks. band.AddBetweenSegments, bruger alfakulstoffet (atom 2) som standardatom, medmindre et andet atom er angivet.
Et Foldit cutpoint bryder midlertidigt peptidbindingen mellem to segmenter. Et “cut band” forbinder alfakarbonerne i de to segmenter, indtil cutpointet er lukket.
Se protein backbone for at få mere at vide om de backbone-komponenter, der er vist her.