Węgiel alfa jest centralnym punktem wszystkich aminokwasów. Przedstawiony tu segment jest połączony z dwoma innymi wiązaniami peptydowymi. (Widok patyczka + biegun H, kolorowanie EnzDes.)
Węgiel alfa jest centralnym punktem w szkielecie każdego aminokwasu.
Węgiel alfa (węgiel α lub Cα) jest tym, co łączy grupę aminową z grupą karboksylową kwasu, nadając aminokwasom ich nazwę.
Węgiel alfa służy również jako punkt zaczepienia dla łańcuchów bocznych 19 z 20 aminokwasów używanych do budowy białek.
Glicyna jest jedynym aminokwasem bez łańcucha bocznego. W glicyny, atom wodoru zajmuje miejsce, gdzie łańcuch boczny jest dołączony do węgla alfa w innych aminokwasów.
Węgiel alfa ma również wodór dołączony naprzeciwko łańcucha bocznego. (Lub, w przypadku glicyny, ma wodór naprzeciwko wodoru, który zastępuje łańcuch boczny.)
Węgiel alfa jest zawsze atomem 2.
Różnice między segmentami są często podawane jako odległość między węglami alfa.
W Foldit, pasmo rysowane do lub od kręgosłupa w efekcie łączy się z węglem alfa. Funkcje tworzenia pasm, takie jak band.AddBetweenSegments używają węgla alfa (atom 2) jako domyślnego atomu, chyba że podano inny atom.
W Foldit cutpoint tymczasowo przerywa wiązanie peptydowe pomiędzy dwoma segmentami. Wstęga cięcia” łączy węgle alfa dwóch segmentów do czasu zamknięcia punktu cięcia.
Zobacz szkielet białka, aby dowiedzieć się więcej o przedstawionych tu komponentach szkieletu.