Perilymfa, která vyplňuje prostor uvnitř kostěného labyrintu obklopujícího membránový labyrint, je svým složením podobná, ale ne totožná s jinými mimobuněčnými tekutinami v těle, jako je mozkomíšní mok. Koncentrace sodíkových iontů v perilymfě je vysoká (asi 150 miliekvivalentů na litr) a koncentrace draslíkových iontů je nízká (asi 5 miliekvivalentů na litr), stejně jako u jiných extracelulárních tekutin. Stejně jako tyto tekutiny je perilymfa zřejmě tvořena lokálně z krevní plazmy transportními mechanismy, které selektivně umožňují látkám pronikat přes stěny kapilár. Ačkoli je anatomicky možné, aby se mozkomíšní mok dostal do hlemýždě cestou perilymfatického kanálku, experimentální studie ukázaly, že je nepravděpodobné, že by se mozkomíšní mok podílel na normální tvorbě perilymfy.
Membránový labyrint je vyplněn endolymfou, která je mezi extracelulárními tekutinami těla, včetně perilymfy, jedinečná tím, že její koncentrace draselných iontů je vyšší (asi 140 miliekvivalentů na litr) než koncentrace sodných iontů (asi 15 miliekvivalentů na litr).
Proces vzniku endolymfy a zachování rozdílu v iontovém složení mezi ní a perilymfou nejsou dosud zcela objasněny. Reissnerova membrána tvoří selektivní bariéru mezi oběma tekutinami. Zdá se, že existují i bariéry krev-endolymfa a krev-perilymfa, které kontrolují průchod látek, jako jsou léky, z krve do vnitřního ucha. Důkazy naznačují, že endolymfa vzniká z perilymfy v důsledku selektivního transportu iontů přes epitelové buňky Reissnerovy membrány, a nikoli přímo z krve. Předpokládá se, že sekreční tkáň zvaná stria vascularis v boční stěně kochleárního kanálku hraje důležitou roli při udržování vysokého poměru draselných a sodných iontů v endolymfě. Předpokládá se, že na udržování iontového složení endolymfy se podílejí i další tkáně hlemýždě a tmavé buňky vestibulárních orgánů, které musí produkovat vlastní endolymfu. Vzhledem k tomu, že membránový labyrint je uzavřený systém, jsou důležité také otázky toku a odstraňování endolymfy. Předpokládá se, že endolymfa je z endolymfatického vaku reabsorbována, i když se zdá, že to je jen část příběhu. Důležitou roli při regulaci objemu a udržování složení tekutin ve vnitřním uchu mohou mít i další kochleární a vestibulární tkáně
.