Polymeraasiketjureaktiotestaus (PCR) saattaa olla virtsan antigeenitestausta parempi legionelloosin diagnosoinnissa, ilmenee European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases -lehdessä julkaistusta tutkimuksesta.
Legionellan suku käsittää yli 50 bakteerilajia ja 70 bakteerin seroryhmää, ja lähes puolet lajeista on yhdistetty ihmisten sairauksiin. Legionella pneumophila seroryhmä 1 (Lp1) on yleisin aiheuttaja. Legionellainfektio aiheuttaa 2 erilaista kliinistä oireilua: Legioonalaistauti, epätyypillinen keuhkokuume, ja Pontiac-kuume, lievä ylähengitystieinfektio, johon liittyy epäspesifinen influenssan kaltainen sairaus. Vaikka hengitystienäytteiden viljelyä pidetään legionelloosin diagnosoinnin kultaisena standardina, se vaatii asiantuntemusta ja useiden päivien inkubointia monimutkaisilla väliaineilla. Niinpä useimmat diagnoosit perustuvat kaupallisiin virtsan antigeenitesteihin näytteenoton helppouden, saman päivän tuloksen, edullisten kustannusten ja analyysin yksinkertaisuuden vuoksi.
Testillä on kuitenkin useita rajoituksia, muun muassa se, että siitä puuttuvat muut kuin Lp1-infektiot (ainakin 21 prosenttia tapauksista jää diagnosoimatta), muut seroryhmät (L pneumophila) ja ei-seroryhmät (L micdadei, L bozemanii ja L longbeachae). Näin ollen liiallinen luottamus virtsan antigeenitesteihin on luonut diagnostisen aukon muiden kuin seroryhmän 1 L pneumophilan ja muiden lajien aiheuttaman legioonalaistaudin osalta. Euroopassa virtsan antigeenitestaus muodostaa 82-90 prosenttia diagnostisista välineistä, joita käytetään legioonalaistaudin varmistamiseen. Yli kymmenen vuotta sitten legionelloosin diagnosointiin otettiin käyttöön reaaliaikaista PCR:ää käyttävät nukleiinihappojen amplifikaatiotestit (NAAT-testit), jotka ovat nykyään yhä useammin kohtuullisella budjetilla toimivien laboratorioiden käytettävissä. Toisin kuin virtsan antigeenitestejä, NAAT-testejä voidaan kehittää kohdistumaan Lp1:een, muihin seroryhmiin ja muihin lajeihin, ja niiden läpimenoaika on huomattavasti lyhyempi kuin viljelytestien, ja niiden spesifisyys on lähes 100 prosenttia ja herkkyys parempi kuin virtsan antigeenitesteillä ja vähintään yhtä hyvä kuin viljelytestien. Siksi tässä monikeskuksisessa retrospektiivisessä tutkimuksessa tutkittiin riskiä, että legionelloosin diagnoosi jää tekemättä, jos luotetaan pelkästään virtsan antigeenitestaukseen.
Tutkijat tekivät retrospektiivisen tutkimuksen 14 belgialaisesta sairaalalaboratoriosta, jotka olivat ottaneet käyttöön sisäisen tai kaupallisen reaaliaikaisen PCR-menetelmän osana ensilinjan testausalgoritmia vakavien hengitystieinfektioiden varalta, ja vertasivat sitä virtsan antigeenitestien tuloksiin. Mukaan otettiin yhteensä 71 rutiininomaisesti saatua tulosta potilailta, joilla oli havaittavissa Legionella-DNA:ta hengitystietutkimusnäytteessä. Lisäksi tehtiin ensisijainen ”käänteistutkimus”, johon osallistuivat kaikki potilaat, joiden virtsa-antigeenitestin tulos oli positiivinen, ja PCR tehtiin sekä ylempien että alempien hengitysteiden näytteestä saman jakson aikana.
Continue Reading
Tulokset osoittivat, että molekulaarisen Legionellan osoittamisen herkkyys oli suurempi alempien hengitysteiden näytteissä verrattuna ylempien hengitysteiden näytteisiin. Kaikkiaan 20 (44,4 %) virtsan antigeenitestauksen tuloksista todettiin väärän negatiivisiksi ja ne luokiteltiin uudelleen legionelloosiksi PCR-löydösten perusteella; tarkemmin sanottuna 15 luokiteltiin legioonalaistaudiksi ja 5 Pontiac-kuumeeksi. Ilman oireyhtymäkohtaista lähestymistapaa yhteensä 26 (39,4 %) diagnoosia olisi todennäköisesti viivästynyt tai jäänyt tekemättä, koska virtsan antigeenitestiä tai spesifistä molekyylitestiä Legionellan varalta ei pyydetty lääkäriltä.
Kaiken kaikkiaan tutkimuksen tekijät päättelivät, että ”PCR on ainoa analyysimenetelmä, jonka avulla on mahdollista etsiä Lp1- sekä muita kuin seroryhmän 1 lajeja ja, kun se on kohdennettu, muita kuin pneumofiilisia Legionellalajeja kliinisesti merkityksellisessä ja riittävässä aikataulussa”.”
viite
Muyldermans A, Descheemaeker P, Boel A, Desmet S, Van Gasse N, Reynders M; infektioserologian kansallisen asiantuntijakomitean puolesta. Mikä on riski, että legionelloosi jää huomaamatta, jos luotetaan pelkästään virtsan antigeenitesteihin? Retrospektiivinen belgialainen monikeskustutkimus . Eur J Clin Microbiol Infect Dis. doi:10.1007/s10096-019-03785-8
.