A missziós papok először 1821-ben celebráltak misét Franklinben, a két helyi katolikus család magánházában. A nashville-i egyházmegye már 1843-ban tervezett egy katolikus templomot Williamson megyében, de a polgárháborút követő ír katolikus vasúti munkások beáramlása volt az, ami lendületet adott a Szent Fülöp katolikus templom 1871-es megalapításához. A munkások kézzel formázták és égették a templom tégláit a helyszínen, és az egész építkezést maguk végezték. P. John Nolan lelkipásztor tehetséges fafaragó volt, aki az 1890-es években saját faragványaival díszítette a templomot és a parókiát is. 1921-ben, az aranyjubileum alkalmából a templom számos alapítójának leszármazottai adományozták az ólomüvegeket. Az 1970-es évek növekedése tette szükségessé a ma látható, négy különálló szentélyt magában foglaló épületek sorozatát, amelyek mindegyike 1976 és 1997 között épült. Ma a főszentélyt a Fő utcán, az 1. sugárútnál található egykori bankból alakították ki, az eredeti épület pedig kápolnaként szolgál. A templomot megelőzően az ingatlan John Eaton franklini ügyvéd, amerikai szenátor és Andrew Jackson elnök alatti hadügyminiszter tulajdonában volt. Eaton és felesége, Peggy olyan botrányba keveredett, amely majdnem megbuktatta a Jackson-kormányzatot.