Atheris squamigera cresce até um comprimento total médio (corpo + cauda) de 46 a 60 cm (cerca de 18 a 24 polegadas), com um comprimento total máximo que por vezes ultrapassa 78 cm (cerca de 31 polegadas). As fêmeas são geralmente maiores que os machos.
A cabeça é larga e plana, distinta do pescoço. A boca tem uma polpa muito grande. A cabeça é espessa e coberta por escamas imbricadas e descascadas. A escama rostral não é visível de cima. Uma escala muito pequena logo acima da rostral é ladeada por escalas muito grandes em ambos os lados. As narinas são laterais. O olho e o nariz estão separados por 2 escalas. Do alto da cabeça, existem 7 a 9 escalas interorbitais. Existem 10 a 18 escalas circunorbitais. Existem 2 (raramente 1 ou mais de 2) filas de escamas que separam os olhos dos lábios. Existem 9 a 12 supralabiais e 9 a 12 sublabiais. Destes últimos, os 2 ou 3 anteriores tocam nos escudos do queixo, dos quais existe apenas um pequeno par. As escalas gulares são descascadas.
Corpo médio há 15 a 23 filas de escalas dorsais, 11 a 17 posteriores. Existem 152 a 175 escalas ventrais e 45 a 67 subcaudais indivisíveis. É possível que haja uma variação nos caracteres morfométricos relacionados com o habitat:
| Mata do Sul | Patagados do Norte | |
| Linhas da escala dorsal do corpo médio | 17 | 21 |
| Escalas centrais | 171 | 168 |
| Escalas subcaudais | 52 | 58 |
A coloração é a mesma em algumas populações, mas variável nos outros. A cor dorsal varia do verde sábio ou verde claro ao verde, verde escuro, azulado, azeitona ou castanho-escuro. Podem ser encontrados espécimes raros que são amarelos, avermelhados ou cinza ardósia. As escamas têm quilhas de cor clara e às vezes pontas amarelas que formam uma série de 30 ou mais bandoleiras ou chevrons claros. Na cauda, existem 10 a 19 chevrons: nem sempre claramente definidos, mas normalmente presentes. A borda ventral do dorso tem manchas claras em pares. Uma cor preta intersticial é visível apenas quando a pele é esticada. A barriga é amarela ou baça a azeitona pálida; pode ser de cor uniforme, ou muito manchada com manchas negras. A garganta às vezes é amarela. A cauda tem a ponta branca marfim, 7 a 12 mm de comprimento, estendendo-se para trás por 10 subcaudais.
Neonates têm uma coloração escura, azeitona com barras onduladas, azeitona mais pálida ou amarelada com margens finas de azeitona escura, barras com intervalos de 5 mm (0,20 in), e uma barriga que é azeitona mais pálida e esverdeada. O padrão de cor adulto desenvolve-se dentro de 3 a 4 meses.