Den holistiska eller biologiska tandvården kan variera mycket när det gäller de tekniker och tjänster som erbjuds. Medan många konventionella tandläkare erkänner att det finns betydande fördelar med olika förebyggande metoder inom tandvården, har en del av dessa tandläkare kritiserat holistiska metoder för bristande effektivitet i tillvägagångssättet och falsk marknadsföring i deras praxis.
En betydande del av kritiken mot holistisk tandvård är relaterad till den ogrundade användningen av vissa tjänster och behandlingar, varav många antingen har undersökts och befunnits vara ineffektiva, eller inte har undersökts tillräckligt mycket för att kunna förklaras vara säkra och effektiva för praktiken. Till exempel rekommenderas ofta växtbaserade läkemedel i form av munskölj och tandkräm för att förebygga eller behandla vissa tandläkemedel. Det är förment säkrare produkter eftersom de är ”naturliga”. Det saknas dock vetenskaplig forskning som stöder sådana behandlingar, och i själva verket har växtbaserade läkemedel visat sig påverka säkerheten vid mer invasiva eller långvariga tandvårdsbehandlingar, och kan leda till ytterligare komplikationer om de interagerar med patientens nuvarande mediciner. Vissa traditionella växtbaserade tandvårdstekniker, t.ex. användningen av Miswak-pinnen, har dock visat sig ha en möjlig effektivitet. Den växtbaserade tandhygienen är dock fortfarande ett område som i stort sett är understuderat, och det kommer att krävas ytterligare rigorösa vetenskapliga utvärderingar för att fastställa olika metoders effektivitet.
Vissa kritiker av holistisk tandvårdspraktik noterar också att de avgifter som tas ut av sådana utövare i allmänhet är flera gånger högre än de som vanliga tandläkare tar ut. Vissa hävdar att alternativ tandvård endast är ett utnyttjande av nischade hälsotankar och gimmicks för att rättfärdiga högre arvoden. Ett potentiellt exempel på detta är Cavitat, en icke validerad ultraljudsapparat som påstås kunna upptäcka påstådda skador som beskrivs som ”kaviteter” (se: neuralgiinducerande kavitationsosteonekros), eller vissa ”biologiska tandläkares” icke evidensbaserade användning av andningsapparater vid avlägsnande av amalgamfyllningar, som är tänkt att minska kvicksilvertoxiciteten genom att eliminera inandningsmaterial i luften. Andra hävdar dock att sådana metoder inte är representativa för hela den holistiska tandvården.