El carbono alfa es el punto central de todos los aminoácidos. El segmento mostrado aquí está unido a otros dos por enlaces peptídicos. (Vista de palo + H polar, coloreado de EnzDes.)
El carbono alfa es el punto central en la columna vertebral de todos los aminoácidos.
El carbono alfa (α-carbono o Cα) es el que conecta el grupo amino con el grupo carboxilo del ácido, dando a los aminoácidos su nombre.
El carbono alfa también sirve como punto de unión para las cadenas laterales de 19 de los 20 aminoácidos utilizados en la construcción de proteínas.
La glicina es el único aminoácido sin cadena lateral. En la glicina, un átomo de hidrógeno ocupa el lugar donde se une una cadena lateral al carbono alfa en los demás aminoácidos.
El carbono alfa también tiene un hidrógeno unido enfrente de la cadena lateral. (O, en el caso de la glicina, tiene un hidrógeno opuesto al hidrógeno que sustituye a la cadena lateral.)
El carbono alfa es siempre el átomo 2.
Las diferencias de segmento a segmento se reportan a menudo como la distancia entre los carbonos alfa.
En Foldit, una banda dibujada hacia o desde la columna vertebral en efecto se conecta al carbono alfa. Las funciones de creación de bandas, como band.AddBetweenSegments utilizan el carbono alfa (átomo 2) como átomo por defecto a menos que se especifique otro átomo.
Un punto de corte de Foldit rompe temporalmente el enlace peptídico entre dos segmentos. Una «banda de corte» conecta los carbonos alfa de los dos segmentos hasta que el punto de corte se cierra.
Vea la columna vertebral de la proteína para más información sobre los componentes de la columna vertebral que se muestran aquí.