La réaction en chaîne par polymérase (PCR) peut être supérieure à la recherche d’antigènes urinaires pour le diagnostic de la légionellose, selon une étude publiée dans le European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases.
Le genre Legionella comprend plus de 50 espèces et 70 sérogroupes de bactéries, près de la moitié des espèces étant associées à des maladies humaines. Legionella pneumophila sérogroupe 1 (Lp1) est la cause la plus fréquente. L’infection à Legionella provoque deux présentations cliniques distinctes : La maladie du légionnaire, une pneumonie atypique, et la fièvre de Pontiac, une infection légère des voies respiratoires supérieures accompagnée d’un syndrome pseudo-grippal non spécifique. Bien que la culture d’échantillons respiratoires soit considérée comme l’étalon-or du diagnostic de la légionellose, elle nécessite une expertise et plusieurs jours d’incubation sur des milieux complexes pour être réalisée. Ainsi, la plupart des diagnostics reposent sur les tests commerciaux d’antigènes urinaires, en raison de la facilité de collecte des échantillons, du résultat le jour même, du faible coût et de la simplicité de l’analyse.
Cependant, ce test présente plusieurs limites, notamment le fait de manquer les infections non-Lp1 (au moins 21 % des cas ne sont pas diagnostiqués), d’autres sérogroupes (L pneumophila) et les non sérogroupes (L micdadei, L bozemanii et L longbeachae). Par conséquent, le recours excessif aux tests d’antigènes urinaires a créé une lacune dans le diagnostic de la maladie du légionnaire causée par L pneumophila de non sérogroupe 1 et d’autres espèces. En Europe, la recherche d’antigènes urinaires représente 82% à 90% des outils diagnostiques utilisés pour la confirmation de la maladie du légionnaire. Il y a plus de dix ans, les tests d’amplification des acides nucléiques (TAAN) utilisant la PCR en temps réel ont été introduits pour le diagnostic de la légionellose et sont aujourd’hui de plus en plus accessibles aux laboratoires disposant d’un budget modéré. Contrairement à la recherche d’antigènes urinaires, les TAAN peuvent être développés pour cibler Lp1, d’autres sérogroupes et d’autres espèces. Ils présentent un délai d’exécution nettement inférieur à celui de la culture, avec une spécificité proche de 100 % et une sensibilité meilleure que celle de la recherche d’antigènes urinaires et égale ou supérieure à celle de la culture. Par conséquent, cette étude multicentrique et rétrospective a examiné le risque de manquer un diagnostic de légionellose en se fiant uniquement à la recherche d’antigènes urinaires.
Les chercheurs ont mené une enquête rétrospective auprès de 14 laboratoires hospitaliers belges qui ont introduit une méthode PCR en temps réel interne ou commerciale dans le cadre d’un algorithme de test de première ligne pour les infections graves des voies respiratoires et ont comparé cette méthode avec les résultats de la recherche d’antigènes urinaires. Au total, 71 résultats obtenus de façon routinière chez des patients dont l’ADN de Legionella était détectable dans un échantillon respiratoire ont été inclus. En outre, une étude primaire « inversée » a été réalisée, qui incluait tous les patients ayant obtenu un résultat positif à la recherche d’antigènes urinaires, et la PCR a été réalisée sur un échantillon des voies respiratoires supérieures et inférieures au cours du même épisode.
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Les résultats ont montré que la détection moléculaire de Legionella avait une plus grande sensibilité dans les échantillons des voies respiratoires inférieures par rapport aux échantillons des voies respiratoires supérieures. Au total, 20 (44,4 %) des résultats des tests d’antigènes urinaires ont été déterminés comme étant faussement négatifs et ont été reclassés comme légionellose sur la base des résultats de la PCR ; plus précisément, 15 ont été classés comme maladie du légionnaire et 5 comme fièvre de Pontiac. Sans l’approche syndromique, un total de 26 (39,4 %) diagnostics auraient très probablement été retardés ou manqués, car les tests d’antigènes urinaires ou les tests moléculaires spécifiques pour Legionella n’étaient pas demandés par les cliniciens.
Dans l’ensemble, les auteurs de l’étude ont conclu que « la PCR est la seule méthode d’analyse permettant de rechercher les Lp1 ainsi que les espèces de Legionella non sérogroupe 1 et, lorsqu’elles sont ciblées, non pneumophiles, dans un délai adéquat et cliniquement pertinent. »
Référence
Muyldermans A, Descheemaeker P, Boel A, Desmet S, Van Gasse N, Reynders M ; au nom du Comité national d’experts en sérologie infectieuse. Quel est le risque de manquer une légionellose en se fiant uniquement à la recherche d’antigènes urinaires ? Une étude rétrospective multicentrique belge. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. doi:10.1007/s10096-019-03785-8
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