El método original de desnatado de proteínas, que consiste en hacer pasar aire a presión a través de un difusor para producir grandes cantidades de microburbujas, sigue siendo una opción viable, eficaz y económica, aunque las tecnologías más nuevas pueden requerir un menor mantenimiento. La piedra de aire suele ser un bloque de madera oblongo y parcialmente ahuecado, casi siempre del género Tilia. Las piedras de aire de madera más populares para los skimmers están hechas de madera de tilo (Tilia europaea o madera de tilo europea), aunque la madera de tilo (Tilia americana o tilo americano), funciona también, puede ser más barata y a menudo está más disponible. Los bloques de madera se perforan, se golpean, se les coloca un accesorio de aire y se conectan con tubos de aire a una o más bombas de aire que suministran al menos 1 pie cúbico por minuto. La piedra de aire de madera se coloca en el fondo de una columna alta de agua. El agua del tanque se bombea hacia la columna, se deja pasar por las burbujas ascendentes y se devuelve al tanque. Para obtener suficiente tiempo de contacto con la burbuja, estas unidades pueden tener muchos pies de altura.
Los desnatadores de proteínas de piedra de aire pueden ser construidos como un proyecto de bricolaje a partir de tuberías de pvc y accesorios a bajo costo y con diversos grados de complejidad.
Aunque este método ha existido durante muchos años, muchos lo consideran ineficiente para los sistemas más grandes o sistemas con grandes cargas biológicas.