Tämä artikkeli tarvitsee lisäviitteitä tarkistusta varten. Auta parantamaan tätä artikkelia lisäämällä viittauksia luotettaviin lähteisiin. Lähteetön materiaali voidaan kyseenalaistaa ja poistaa.
Lähteiden löytäminen: ”Fold change” – news – newspapers – books – scholar – JSTOR (February 2010) (Learn how and when to remove this template message)

Fold change is a measure describing how much a quantity changes between an original and a subsequent measurement. Se määritellään kahden suureen välisenä suhteena; suureiden A ja B osalta B:n kertainen muutos suhteessa A:han on B/A. Toisin sanoen muutos 30:stä 60:een määritellään 2-kertaiseksi muutokseksi, jota kutsutaan myös ”2-kertaiseksi kasvuksi”. Vastaavasti muutosta 30:stä 15:een kutsutaan ”2-kertaiseksi vähenemiseksi”. Kertausmuutosta käytetään usein analysoitaessa biologisen järjestelmän useita eri aikoina tehtyjä mittauksia, koska aikapisteiden välisen suhteen kuvaama muutos on helpompi tulkita kuin ero.

Kertausmuutosta kutsutaan niin, koska on tavallista kuvata moninkertaista X:n kasvua ”X-kertaiseksi kasvuksi”. Sellaisenaan useat sanakirjat, kuten Oxford English Dictionary ja Merriam-Webster Dictionary sekä Collins’s Dictionary of Mathematics, määrittelevät ”-kertaisen” tarkoittavan ”kertaa”, kuten ”2-kertainen” = ”2 kertaa” = ”kaksinkertainen”. Todennäköisesti tämän määritelmän vuoksi monet tutkijat käyttävät ”fold”:n lisäksi myös ”fold change” -sanaa ”kertaa” synonyyminä, kuten ”3-fold larger” = ”3 kertaa suurempi”.

Fold change käytetään usein mikroarray- ja RNA-Seq-kokeista saatujen geeniekspressiodatan analysoinnissa geenin ekspressiotason muutoksen mittaamiseen. Haittapuolena ja vakavana riskinä taittomuutoksen käyttämisessä tässä yhteydessä on se, että se on puolueellinen ja saattaa luokitella väärin sellaiset differentiaalisesti ilmentyneet geenit, joilla on suuret erot (B – A) mutta pienet suhteet (B/A), mikä johtaa korkeilla ilmentymistasoilla tapahtuvien muutosten huonoon tunnistamiseen. Lisäksi kun nimittäjä on lähellä nollaa, suhde ei ole vakaa, ja mittauskohina voi vaikuttaa mittauskohinaan suhteettoman paljon.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.