Denna artikel behöver ytterligare citat för verifiering. Hjälp till att förbättra den här artikeln genom att lägga till citat till tillförlitliga källor. Otillgängligt material kan ifrågasättas och tas bort.
Hitta källor: ”Fold change” – news – newspapers – books – scholar – JSTOR (februari 2010) (Learn how and when to remove this template message)

Fold change är ett mått som beskriver hur mycket en kvantitet förändras mellan en ursprunglig och en efterföljande mätning. Det definieras som förhållandet mellan de två storheterna; för storheterna A och B är B:s vikningsförändring i förhållande till A B/A. Med andra ord definieras en förändring från 30 till 60 som en vikningsförändring på 2. Detta kallas också för en ”2-faldig ökning”. På samma sätt kallas en förändring från 30 till 15 för en ”2-faldig minskning”. Fold change används ofta när man analyserar flera mätningar av ett biologiskt system som gjorts vid olika tidpunkter eftersom den förändring som beskrivs av förhållandet mellan tidpunkterna är lättare att tolka än skillnaden.

Fold change kallas så eftersom det är vanligt att beskriva en ökning av flera X som en ”X-faldig ökning”. Som sådan definierar flera ordböcker, inklusive Oxford English Dictionary och Merriam-Webster Dictionary samt Collins’s Dictionary of Mathematics, ”-fold” för att betyda ”gånger”, som i ”2-fold” = ”2 gånger” = ”dubbelt”. Troligen på grund av denna definition använder många forskare inte bara ”fold” utan även ”fold change” som synonymt med ”times”, som i ”3-fold larger” = ”3 times larger”.

Fold change används ofta vid analys av genuttrycksdata från mikroarray- och RNA-Seq-experiment för att mäta förändringen i uttrycksnivån för en gen. En nackdel och allvarlig risk med att använda fold change i denna miljö är att den är partisk och kan felklassificera differentiellt uttryckta gener med stora skillnader (B – A) men små förhållanden (B/A), vilket leder till dålig identifiering av förändringar på höga uttrycksnivåer. När nämnaren är nära noll är förhållandet dessutom inte stabilt, och värdet för fold change kan påverkas oproportionerligt mycket av mätningsbrus.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.