Ten artykuł wymaga dodatkowych cytatów do weryfikacji. Prosimy o pomoc w ulepszeniu tego artykułu poprzez dodanie cytatów do wiarygodnych źródeł. Unsourced material may be challenged and removed.
Find sources: „Fold change” – news – newspapers – books – scholar – JSTOR (February 2010) (Learn how and when to remove this template message)

Fold change jest miarą opisującą, jak bardzo zmienia się wielkość pomiędzy oryginalnym a kolejnym pomiarem. Definiuje się ją jako stosunek między dwiema wielkościami; dla wielkości A i B, zmiana fałdowa B w odniesieniu do A wynosi B/A. Innymi słowy, zmianę z 30 na 60 określa się jako zmianę 2-krotną. Jest to również określane jako „2-krotny wzrost”. Analogicznie, zmiana z 30 na 15 jest określana jako „2-krotny spadek”. Zmiana fałdowa jest często stosowana podczas analizy wielu pomiarów systemu biologicznego wykonanych w różnym czasie, ponieważ zmiana opisana przez stosunek między punktami czasowymi jest łatwiejsza do zinterpretowania niż różnica.

Zmiana fałdowa jest tak nazywana, ponieważ często opisuje się wzrost wielokrotności X jako „X-krotny wzrost”. Jako takie, kilka słowników, w tym Oxford English Dictionary i Merriam-Webster Dictionary, jak również Collins’s Dictionary of Mathematics, zdefiniować „-fold” oznacza „razy”, jak w „2-fold” = „2 razy” = „podwójne”. Prawdopodobnie z powodu tej definicji, wielu naukowców używa nie tylko „fold”, ale także „fold change” jako synonimu „times”, jak w „3-fold larger” = „3 razy większy”.

Fold change jest często używany w analizie danych ekspresji genów z mikromacierzy i eksperymentów RNA-Seq do pomiaru zmian w poziomie ekspresji genu. Wadą i poważnym ryzykiem stosowania zmiany fałdowej w tym kontekście jest to, że jest ona nieobiektywna i może błędnie klasyfikować różnie wyrażone geny z dużymi różnicami (B – A), ale małymi stosunkami (B/A), co prowadzi do słabej identyfikacji zmian na wysokich poziomach ekspresji. Ponadto, gdy mianownik jest bliski zeru, stosunek nie jest stabilny, a wartość zmiany fałdowej może być nieproporcjonalnie dotknięta przez szum pomiarowy.

.

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.