教皇改革
ピオ4世の死後、ピオ4世の甥の枢機卿（後の聖）チャールズ・ボロメオを中心とする厳格な宗教規則の信者は、難なく彼を教皇にする（1566年1月7日）ことができました。 ピウスは禁欲的な生活を続けながら、直ちに改革に着手した。 娼婦は街から追い出されるか、ある区域に閉じ込められ、日曜日の冒涜、冒涜、動物虐待に対する罰則が定められ、聖職者は一定期間、行政区域で過ごすことが求められ、修道院のメンバーは誓約に従って厳しい隠遁生活を強いられ、カテキズム（カトリック精神の原則を示した短いマニュアル）の指導も命じられた。 1566年に新しいカテキズムが発表され、その後改良されたブレヴィアリー（聖職者と修道女のための日々の祈り）や改良されたミサル（ミサを行うための祈りと応答を記した本）が発表された。 8818>
ピウスは縁故採用の反対を公言していた。 確かに彼は一人の甥を枢機卿にしたが、彼は何の影響力も持つことを許されず、一族の残りの者は距離を置かれた。 1567年3月29日に発布された憲法「アドモネ・ノス」によって、彼は領地（封建的土地所有権のうち、聖座に返還される予定のもの）の再投資を禁じ、枢機卿たちにそれを守るよう宣誓を課したのである。 1569年3月、ピウスは教会国家からのユダヤ人の追放を命じたが、商業上の理由から、ローマとアンコーナに屈辱的な条件で留まることが許された。 1571年2月、ミラノの腐敗した修道会であるフミリアーティが、大司教のボロメオ枢機卿の命を狙ったという理由で弾圧された
異端審問を管理する規則は鋭くなり、長い間停止していた古い罪状が復活しました。階級は保護を与えるものではなく、むしろその所有者をより激しい攻撃にさらすことになったのです。 プロテスタントの教義が多く受け入れられていた知識人ほど、執拗に追及された者はいなかった。 諸侯や国家は異端者の保護を取りやめ、優れた犯罪者を引き渡すことで聖座の好意を引き出そうとした。 スペインのフィリップ2世は1566年、スペインの神学者でイギリス女王メアリーの元告白者バルトロメ・デ・カランサを降伏させ、コジモ・デ・メディチは1567年、パウロ4世の教皇時代から疑われていたフィレンツェの異端者ピエトロ・カルネセッキ（2年後に報酬としてトスカーナ大公の称号を受ける）を降伏させている。 1571年3月には、異端審問とは別に、信仰や道徳に害を与えるとして断罪された書物のリストである「インデックス」の特別会が設立され、数百人の印刷業者がスイスやドイツに逃亡した。 ピウスが悔やんだのは、時に甘すぎたということだった。 スペインのフィリップ2世には、オランダの臣民をカトリックの信仰に従わせるために最も冷酷な専制政治を行うよう勧め、フランスにはカトリーヌ・ド・メディシスのユグノー弾圧を助けるために軍隊を送った。また神聖ローマ皇帝ルドルフ2世の示した寛容さに抗議を行った＜8818＞。