Das Alpha-Kohlenstoff ist der zentrale Punkt aller Aminosäuren. Das hier gezeigte Segment ist mit zwei anderen durch Peptidbindungen verbunden. (Stick + polare H-Ansicht, EnzDes-Färbung.)
Das Alpha-Kohlenstoff ist der zentrale Punkt im Rückgrat jeder Aminosäure.
Das Alpha-Kohlenstoffatom (α-Kohlenstoff oder Cα) ist das Bindeglied zwischen der Aminogruppe und der Carboxylgruppe der Säure und gibt den Aminosäuren ihren Namen.
Das Alpha-Kohlenstoffatom dient auch als Anknüpfungspunkt für die Seitenketten von 19 der 20 Aminosäuren, die im Proteinaufbau verwendet werden.
Glycin ist die einzige Aminosäure ohne Seitenkette. Bei Glycin nimmt ein Wasserstoffatom die Stelle ein, an der bei den anderen Aminosäuren eine Seitenkette an den Alpha-Kohlenstoff gebunden ist.
Das Alphakohlenstoffatom ist ebenfalls mit einem Wasserstoffatom gegenüber der Seitenkette verbunden. (Oder, im Fall von Glycin, hat es einen Wasserstoff gegenüber dem Wasserstoff, der die Seitenkette ersetzt.)
Das Alpha-Kohlenstoffatom ist immer Atom 2.
Segment-zu-Segment-Unterschiede werden oft als Abstand zwischen den Alpha-Kohlenstoffen angegeben.
In Foldit verbindet sich eine Bande, die zum oder vom Rückgrat gezogen wird, tatsächlich mit dem Alpha-Kohlenstoff. Die Bandenfunktionen, wie z. B. band.AddBetweenSegments, verwenden das Alpha-Kohlenstoffatom (Atom 2) als Standardatom, sofern kein anderes Atom angegeben wird.
Ein Foldit-Schnittpunkt unterbricht vorübergehend die Peptidbindung zwischen zwei Segmenten. Ein „Schnittband“ verbindet die Alphakohlenstoffe der beiden Segmente, bis der Schnittpunkt geschlossen wird.
Siehe Proteinrückgrat für weitere Informationen zu den hier gezeigten Rückgratkomponenten.